小孩雙國籍護照問題 - 馬來西亞

各位同鄉好，小弟是馬來西亞人，太太是台灣人。小女在台灣出生兩國護照都已經辦好了
且月底要回大馬一趟。
現在問題來了，由於我是怡保人，不可能經由新加坡回馬，必須直飛KLIA。
請問小女的兩國護照如何使用？還是說大馬護照從頭到尾都不要用，以外國人身份入境。
另外就是如果大馬護照完全不使用，以後在台北辦更新時會遭到官員刁難嗎？
謝謝大家的解答和建議。

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