打工渡假簽證入關問題 - 日本

不好意思，想請問一下。
我在今年申請到打工渡假的簽證，
也在11/1時從桃園機場飛往關西機場。
家人有參加其他旅行團陪我一起來，但我是另外買個人機票。
但在入關時要勾選"渡航目的"時，勾選了「觀光」。
(其實我不清楚到底是不是這個原因@@)
但我當時有翻簽證給海關看啊...
總之，我今天要去地方役所辦理外國人登錄手續時，
才發現我的"上陸許可"只有90天。
這樣是代表我目前還是持觀光簽而不是用打工渡假簽進入日本嗎？
有點混亂...不好意思@@

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